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zymo RNA文庫構(gòu)建試劑盒(去除核糖體RNA)
  • 品牌:zymo
  • 產(chǎn)地:美國(guó)
  • 貨號(hào):R3000
  • 發(fā)布日期: 2021-02-04
  • 更新日期: 2024-08-06
產(chǎn)品詳請(qǐng)
產(chǎn)地 美國(guó)
品牌 zymo
貨號(hào) R3000
用途 RNA文庫構(gòu)建
包裝規(guī)格 12 Preps
純度 %

Cat #

Name

Size

R3000

Zymo-Seq   RiboFree Total RNA Library Kit

12 Preps

R3003

Zymo-Seq   RiboFree Total RNA Library Kit

96 Preps

 

產(chǎn)品亮點(diǎn):


  • 最快和*的總RNA-Seq庫試劑盒:準(zhǔn)備在      3.5 小時(shí)內(nèi)從總      RNA 中準(zhǔn)備擱淺的      RiboFree 庫。

  • 與任何有機(jī)體兼容:無探針技術(shù)從任何RNA源中消耗rRNAGlobin。

  • 最準(zhǔn)確的:消除 rRNA 損耗的偏差。

產(chǎn)品描述:


·         Zymo-Seq RiboFree Total RNA-Seq Library Kit是最快、*的 RNA-Seq 庫制備套件,可形成鏈狀,總RNA庫。自動(dòng)化友好的協(xié)議*限度地減少了動(dòng)手時(shí)間,從而在 3.5 小時(shí)內(nèi)生成了去除的 rRNA globin 的文庫。核糖體RNA(可占RNA樣本總數(shù)的90%)的耗竭完全集成到工作流程中,使用一種新穎的、無探針的技術(shù),從任何樣品類型或物種中去除rRNA、球蛋白來自任何樣本類型或物種的過多的、重復(fù)的轉(zhuǎn)錄本。已在生物界和生物門得到驗(yàn)證,包括人類、嚙齒動(dòng)物、植物和各種原核生物,以及來自各種樣本類型的RNA,包括細(xì)胞、組織、FFPE組織和全血,無需為不同樣本類型選擇樣本特定模塊。由于Ribfree通用耗能是無探針的,研究人員使用Zymo-Seq RiboFreeRNA庫試劑盒將避免在其他方法中發(fā)現(xiàn)的轉(zhuǎn)錄組分析偏差。基于探針的方法中使用的高濃度的rRNA結(jié)合寡核苷酸也與大量非核糖體靶點(diǎn)結(jié)合。在人類基因組的20000個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因中,有20%被這些方法明顯偏頗。相比之下,Zymo Research開發(fā)的無探針消耗法僅使用大量已有的轉(zhuǎn)錄本,對(duì)rRNA和珠蛋白進(jìn)行無錯(cuò)配酶去除,導(dǎo)致在所有蛋白編碼轉(zhuǎn)錄本中最小的脫靶效應(yīng)低至1.8%該total RNA- seq library prep kit的協(xié)議是無碎片的,工作與多達(dá)2 ug的未耗盡總RNA,下降到50 ng的未耗盡總RNA,或只有5 ng的核糖體耗盡RNA樣本。預(yù)混合試劑是隨時(shí)可以使用的每一步,消除了需要手工主混合準(zhǔn)備。試劑盒包含需要的測(cè)序準(zhǔn)備庫,包括引物索引,SPRI珠,和磁珠支架。這使RNA-Seq制備簡(jiǎn)單化。

技術(shù)規(guī)格


所需設(shè)備

熱循環(huán)器、磁鐵支架*和微離心器。

輸入質(zhì)量

確保RNA A260/A280   A260/A230比率為≥ 1.8,無DNA,PCR抑制劑無高保真cDNA轉(zhuǎn)錄和損耗

*輸入

5 μg

最小輸入

100納克

處理時(shí)間

只要 3.5 小時(shí)(RNA 到索引庫)

推薦輸入

500納克

樣品輸入材料

來自任何物種的RNA

測(cè)

與所有 Illumina ®兼容。Read 1 序列對(duì)原源的 RNA 分子具有反義性。

 

問題 1 此套件是否會(huì)與原核生物一起使用?

是的,這個(gè)工具包將工作與任何有機(jī)體。只要您的樣品有 rRNA,此試劑盒就會(huì)起作用。

問題 2 我的樣品低于 100 ng, 此工具包是否仍然工作?

較低的樣品輸入將需要更長(zhǎng)的孵育時(shí)間,在Ribfree通用消耗期間。有關(guān)建議,請(qǐng)參閱附錄 B

Cat #

Name

Size

E2003

ZymoTaq PreMix

(50 Rxns.) (2   x 625 μl)

E2004

ZymoTaq PreMix

(200 Rxns.) (8   x 625 μl)

W1001-10

DNase/RNase-Free   Water

10 ml

W1001-1

DNase/RNase-Free   Water

1 ml

D4084-50

Select-a-Size   MagBead Set

50 ml

D4084-10

Select-a-Size   MagBead Set

10 ml

D3004-4-10

DNA Elution   Buffer

10 ml

D3004-4-50

DNA Elution   Buffer

50 ml

3DP-1002

PCR Strip   MagStand

1 unit

R3001

Zymo-Seq   RiboFree Universal cDNA Kit

12 Preps

D3008

Zymo-Seq UDI   Primer Set (Indexes 1-12)

12 indexes

D3096

Zymo-Seq UDI   Primer Plate (Indexes 1-96)

96 Indexes

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