Illumina
美國Illumina公司自2006年進(jìn)軍基因測(cè)序市場(chǎng)以來，陸續(xù)發(fā)布了HiSeq、MiSeq、NextSeq等一系列測(cè)序儀器。
（Illumina公司的各型號(hào)測(cè)序儀）
測(cè)序方法采用邊合成邊測(cè)序的方法，基于專有的可逆終止化學(xué)反應(yīng)原理。測(cè)序時(shí)將基因組DNA的隨機(jī)片段附著到光學(xué)透明的玻璃表面（即Flow cell），這些核酸片段經(jīng)過延伸和橋式擴(kuò)增后，在Flow cell上形成了數(shù)以億計(jì)Cluster，每個(gè)Cluster是具有數(shù)千份相同模板的單分子簇。然后利用帶熒光基團(tuán)的四種特殊脫氧核糖核苷酸，通過可逆性終止的SBS（邊合成邊測(cè)序）技術(shù)對(duì)待測(cè)的模板DNA進(jìn)行測(cè)序。
（Illumina測(cè)序原理）
illumina 平臺(tái)眾多，各有側(cè)重，適合不同樣本測(cè)序，下面介紹illumina主流測(cè)序儀器的區(qū)別，大家可根據(jù)實(shí)際需求選擇合適的測(cè)序平臺(tái)！
不同儀器應(yīng)用如下：
第二代測(cè)序技術(shù)的核心思想是邊合成邊測(cè)序（Sequencing By Synthesis），即通過捕捉新合成的末端的標(biāo)記來確定DNA的序列，其中Illumina公司處于一個(gè)壟斷地位，下面就illumina產(chǎn)品進(jìn)行介紹：
詳細(xì)介紹如下：
MiniSeq系統(tǒng)：門檻最低、最易于實(shí)現(xiàn)的測(cè)序解決方案。即使是少量的樣本，它也能夠?qū)崿F(xiàn)經(jīng)濟(jì)高效的測(cè)序。
單次數(shù)據(jù)產(chǎn)出范圍在1.65-7.5Gb
Reads數(shù)：7-25 million
應(yīng)用：靶向基因、小基因組、擴(kuò)增子測(cè)序、16S宏基因組學(xué)等。
MiSeq 系統(tǒng)：適用于快速、省成本的二代測(cè)序可以在單次運(yùn)行中讀取
2X300bp的長度。
單次數(shù)據(jù)產(chǎn)出范圍在540Mb-15Gb
Reads數(shù)：1-25 million（v2達(dá)到15 million，v3達(dá)到 25million）
應(yīng)用：靶向基因、小基因組、擴(kuò)增子測(cè)序、16S宏基因組學(xué)等。
NextSeq 550系統(tǒng)：快速、靈活、高通量的臺(tái)式測(cè)序儀，在Illumina測(cè)序技術(shù)準(zhǔn)確性的基礎(chǔ)上，實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄組和靶向重測(cè)序應(yīng)用。
可以在單次運(yùn)行中讀取2X150bp的長度。
單次數(shù)據(jù)產(chǎn)出范圍在1.65-7.5Gb
Reads數(shù)：7-25 million
應(yīng)用：在Illumina測(cè)序技術(shù)準(zhǔn)確性的基礎(chǔ)上，實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄組和靶向重測(cè)序應(yīng)用。
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